集群大部分节点不联外网,自己本地电脑下载,再通过fz上传比较麻烦
此工具利用RNA小服务器上的虚拟机与集群交互,自动下载上传集群
这样不仅可以免去一些机械的人工操作,而且还能避免本地PC下载中断
交互用的就是shell里自带的except,简单粗暴
自动登录在集群上登录内网小服务器,此小服务器可联外网,小服务器上下载完毕,scp上传集群,然后删除小服务器上的文件

这篇文献主要介绍了lncScore，用python写的一个脚本,主要是依赖一个机器学习第三方库scikit-learn。它能够通过开放阅读框,外显子和最大编码子序列等11个特征参数对lncRNA进行筛选。为了加快lncScore的运行速度，主要采用多线程>分析，只需花费2分钟的时间就能够对64,756个转录本进行分类。
文章里用gencode数据库里的lncRNA数据做了验证
此工具与CPAT, CNCI 和 PLEK类似，我们的lncRNA流程里的编码潜能预测软件用的是CPC CNCI Pfam，貌似CPC也是这个团队开发的。有时间把这几个软件都看一下。