tophat-fusion软件分析说明

TopHat-Fusion可以从单端或双端的RNA-seq数据中识别融合基因。它将首次未比对到基因组上的reads进行打断，通过重新比对寻找候选的融合基因，后续采用多重规则进行过滤和筛选。该算法不依赖于已知的基因注释信息，这使其具有更高的敏感性，除了鉴定已知基因的融合，它还可以发现来自新基因或已知基因新剪切体的融合产物

经常在一些文章中看到如下这样的图：

这个图里，显然是把每个基因相应的部分都分成了相同的份数，也就是分成了一个个bin，在统计每个bin里所有基因的甲基化位点数的总和，然后再计算成甲基化水平。